Sala Bałtycka mieści się na trzecim, najwyższym piętrze budynku Akwarium Gdyńskiego. To przestrzeń muzealna dedykowana naszemu morzu. Na umieszczonej w centrum sali mapie plastycznej można zobaczyć całą topografię Bałtyku i odnaleźć tak charakterystyczne miejsca, jak głębie, wyspy czy miasta portowe. W gablotach obejrzeć można eksponaty reprezentujące wszystkie grupy bałtyckich organizmów, w tym goszczące w cieśninach duńskich rekiny.

Z okien tej Sali rozpościera się zapierający dech w piersiach widok na Zatokę Gdańską. Dostrzec można stąd klif w Gdyni Orłowie, a w przypadku dobrej widoczności Półwysep Helski.

W Sali Bałtyckiej można obejrzeć również wystawę przygotowaną przez Ghost Diving Poland. Wystawa omawia problem sieci widm, czyli zagubionych sieci rybackich, które pozostawione w morzu mogą wciąż stanowić pułapkę dla ryb. Nurkowie z Ghost Diving zajmują się wyławianiem takich sieci, a także innych znalezionych pod wodą odpadów. Odpady, które zbiorą poddawane są recyklingowi.